インディペンデンテ FC(スペイン語: Independiente F.C.)は、エルサルバドルのサン・ビセンテ州サン・ビセンテを本拠地とするサッカークラブである。現在は、エルサルバドルのプロサッカーリーグであるプリメーラ・ディビシオンに所属している。

インディペンデンテ FCは、1949年に設立された。1960年代には、プリメーラ・ディビシオンで4度の優勝を果たした。しかし、その後は低迷が続き、1990年代にはセグンダ・ディビシオン(2部)に降格した。2000年代に入って、再びプリメーラ・ディビシオンに昇格し、現在は中堅クラブとして定着している。

インディペンデンテ FCのホームスタジアムは、エスタディオ・アントニオ・サカリタス・イガルタである。収容人数は5,000人。

インディペンデンテ FCのライバルは、同じサン・ビセンテ州に本拠地を置くクラブ、CDアウチャパンとCDウィクワは長い間ライバル関係を築いてきた。